不同休眠時期珠芽魔芋球莖轉(zhuǎn)錄組SSR和SNP位點(diǎn)信息分析

摘要： 為了解珠芽魔芋球莖轉(zhuǎn)錄組中SSR以及SNP的具體情況，對珠芽魔芋不同休眠時期(休眠期,萌動期,萌芽期)的球莖進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，利用MISA和Varscan程序?qū)y序得到的unigene進(jìn)行分析，篩選并識別出SSR和SNP位點(diǎn)。結(jié)果顯示，從珠芽魔芋292 086條unigene中發(fā)現(xiàn)52 324個SSR位點(diǎn)和807 836個SNP位點(diǎn)，SSR位點(diǎn)的出現(xiàn)頻率為17.91%；單核苷酸(...